刘雷上海生物信息技术研究中心副主任

发布日期:2014-07-29

刘雷,博士,研究员,中国科学院2007通过“百人计划”引进的海外杰出人才。现任上海生物信息技术研究中心副主任。刘雷博士1988年毕业于北京大学生物系遗传专业;1991年毕业于中国科学院发育生物学研究所,获硕士学位;1997年毕业于美国康涅狄格大学,获细胞生物学博士学位。毕业后在美国康涅狄格大学计算机系继续博士后工作。曾任美国伊利诺伊大学香槟分校生物技术中心生物信息学实验室主任。在美国期间已住持过多个NIH、NSF、USDA项目,如NIH皮肤病研究中心信息化研究等。2007年回国后,着重生物医学信息学研究,承担和参与了多项国家和地方重大科学研究计划,包括承担国家“十一五”“863”计划生物技术领域“建立基于临床医疗信息共享平台的医疗决策支持系统”重大项目,参与国家传染病重大专项“病毒性肝炎相关肝癌样本库及其相关共享数据库的建设及维护”课题等。2008年入选上海市“浦江人才计划”。多年从事生物医学信息学研究,不但致力于基础研究,更注重转化研究。在基因组数据的拼接与注释,比较基因组学,基因芯片数据的分析与挖掘,生物网络的构建与分析,生物系统的建模与模拟,医疗数据共享、整合与挖掘,临床决策支持,个性化医疗等方面做了大量工作,取得了一系列创新性成果。在转录调控网络及网络动态建模上提出了microRNA以转录因子为介导的两层调控机制;通过系统建模与模拟解析了细胞周期和生物时钟节律互相钳制的动态关系;创建了整合酶活性调控机制的代谢动力学模型;开发了基于基因本体模块的表达谱分析方法,可根据表达谱准确地找到生物功能相似的小分子及其相关的作用途径,在新药研发、药理毒理、小分子调控研究等方面具有广泛的应用前景。 近年研发了一系列医疗卫生软件系统,如:应用于医疗科研与实验的临床样本库管理系统;医疗信息共享与整合的平台信息系统,可将多家的异构数据进行整合,已获得软件著作权,并申请了专利;结合基础研究中的组学数据,开发了基于基因多样性的个性化医疗临床决策支持系统,将基因、疾病、药物的信息相关联与整合。已获得多个软件著作权,并申请了专利。近三年来获得了15项软件著作权,申请了三项专利。 先后在《Bioinformatics》、《PLoS Computational Biology》、《Nucleic Acid Research》《Journalof Biomedical informatics》等国际上有较大影响的学术刊物及学术会议上发表论文40余篇,绝大多数的论文影响因子在3.0以上。同时还应邀撰写了四部专著的部分章节,共同主编了《中国医疗卫生信息化进展》一书。